得系统性红斑狼疮的确切病因不是很清楚，目前认为是跟人体的免疫系统被异常激活，攻击自身组织有关系。另外它跟遗传、环境因素及雌激素水平有关。首先是遗传因素，研究发现，系统性红斑狼疮家族中患结缔组织病的几率明显增加，红斑狼疮患者的一级亲属患红斑狼疮的风险是普通人的8倍，单卵双胞胎红斑狼疮发病率是异卵双胞胎的5~10倍，这些提示红斑狼疮发病与遗传基因有关。其次是环境因素，狼疮患者在阳光暴晒以后容易发病，某些药物可以诱发药物性狼疮，某些病原微生物感染以后引起免疫系统产生自身抗体，导致狼疮发生。最后是跟?激素有关，育龄期妇女红斑狼疮的发病率明显多于男性，女男比是9:1，妊娠期雌激素分泌量急剧增加，狼疮病情也加重，这些情况提示，雌激素和系统性红斑狼疮的发病密切相关。