细菌性咳嗽，主要是由于细菌感染引起的呼吸系统的炎症，包括急性上呼吸道感染、支气管炎、肺炎，可以服用对症治疗和抗生素治疗。对症治疗主要是用能够化痰、止咳功效的药物，比如羧甲司坦口服液、氨溴索糖浆、蜜炼川贝枇杷膏、蛇胆川贝液以及棕色合剂等。抗生素可以选择服用阿莫西林、头孢呋辛、头孢克罗、头孢哌酮等药物，还可以选择阿奇霉素、罗红霉素、左氧氟沙星。如果患者出现耐药菌株的出现，应该及时的取咳出的痰液，做病原体的培养及药物敏感试验，选择敏感的抗生素，随时调整服用药物的方案。