嗓子疼痛的时候，应当服用下列药物进行治疗：1.病毒感染造成的嗓子疼痛，例如病毒性扁桃体炎、病毒性咽炎，或者是病毒性疱疹咽峡炎等疾病，可以选用抗病毒合剂、阿昔洛韦、干扰素等抗病毒药物治疗。2.咽喉部位的烧灼伤导致的嗓子疼痛，可以选用维生素类的药物，或者是康复新液等促进局部黏膜生长的药物进行治疗。3.因为口腔内的炎症感染所造成的嗓子疼痛，可以使用复方氯己定含漱液、呋喃西林溶液等药物对口腔进行抗菌治疗。