肛门经常疼痛，选择的药物需要根据病因来决定，不可以盲目用药，可以给予局部涂抹药膏，肛内塞药、结合口服药物治疗。肛门经常发生疼痛，是由多方面的因素引起的，如果是肛裂引起的疼痛，可以应用高锰酸钾坐浴，结合涂抹红霉素软膏治疗。如果是肛门发炎引起的疼痛，可以口服消炎药物结合用中药坐浴，肛门局部涂抹消炎的药膏治疗。如果是直肠炎引起的肛门疼痛，肛门局部可以涂抹莫匹罗星软膏，口服抗感染止泻的药物治疗，平时要注意肛周的卫生，保持清洁干燥，避免加重感染。