用于治疗泌尿系统感染的药物分为西药及中药中成药。常见西药种类包括：一、喹诺酮类，代表药物为左氧氟沙星、环丙沙星，其尿液中代谢成分含量很高，适合治疗泌尿系各类型感染；二、头孢菌素类，这是一种广谱抗生素，如头孢克肟、头孢氨苄，副作用相对较小，亦适合同时治疗泌尿系之外的病变；三、青霉素类例如阿莫西林，使用历史长远，在其他类型药物不敏感或过敏情形下采用。中成药用于消炎者其药物成分多少含有西药成分，另外传统中成药亦有疗效。