根据结膜炎的种类不同，一般情况下使用的眼药水也会有所不同。如果是流行性的结膜角膜炎，可以使用一比四千的高锰酸钾溶液洗眼，每日数次，并且可选用1%到5%的盐酸吗啉胍溶液，百分之0.1的疱疹净溶液，0.05%的环孢素滴眼液，抗生素眼膏或者是溶液等滴眼。对于过敏性结膜炎和病毒性结膜炎，抗生素治疗无效，如果是过敏性结膜炎可以口服抗组胺药，可以止痒和缓解刺激症状，如果无效，也可以试用皮质类固醇眼药水。一般情况下，对于病毒性结膜炎，患者可以使用可的松滴眼液，对于细菌性结膜炎可以使用氧氟沙星滴眼液。