衣原体是一组专性的细胞内寄生微生物，有DNA或RNA两种核酸。衣原体为250到500nm大小，球状，革兰染色阴性，有细胞壁，内含精氨酸，有核糖体及各种代谢所需的酶。衣原体可能引起人类多种疾病，比如沙眼、包涵体结膜炎、非淋菌性尿道炎、子宫颈炎、附睾炎、直肠炎、输卵管炎、子宫内膜炎、新生儿肺炎、性病性淋巴肉芽肿及鹦鹉热。衣原体引起的疾病范围广泛，可累及眼、生殖道和其他脏器。在女性，引起的疾病包括有症状和无症状的宫颈炎、肝周围炎、急性输卵管炎、并可继发不育。在男性，引起的疾病包括有症状和无症状的尿道炎和急性附睾炎。男女性均可发生衣原体直肠炎、结膜炎等。沙眼衣原体也可导致母婴传播。