腋下淋巴结疼痛的原因有很多，大致可以包括以下几个方面：一、有一些病原体的感染，主要包括细菌、病毒、结核等感染而引起的腋下淋巴结肿大、疼痛；二、患者如果为女性的话，很有可能是乳腺方面的疾病而引起腋下淋巴结的疼痛，比如说有可能是有由于乳腺增生、乳腺炎、乳腺恶性肿瘤、副乳增生等疾病都会引起腋下淋巴结的疼痛；三、还有一些患者如果是淋巴瘤或者是其它部位的恶性肿瘤而导致腋下淋巴结的肿大疼痛。因此，患者可能需要完善一定的检查和检验来明确原因，从而进行对因治疗。