甲氨喋呤副作用包括以下几方面：一、胃肠道反应，如口腔炎、口唇溃疡、咽喉炎，以及恶心、呕吐、腹痛、腹泻、消化道出血等胃肠道不良反应。二、肝功能损害，患者可能出现黄疸，丙氨酸氨基转移酶、碱性磷酸酶、γ-谷氨酰转肽酶等数值升高。长期口服甲氨喋呤可导致肝细胞坏死、脂肪肝、纤维化，甚至肝硬化。三、由于甲氨喋呤和甲氨喋呤代谢产物沉积在肾小管，易导致高尿酸血症、肾病，甚至尿毒症等。四、长期使用甲氨喋呤可引起咳嗽、气短、肺炎或肺纤维化。五、骨髓抑制，表现为白细胞和血小板减少；长期口服小剂量甲氨喋呤可导致明显骨髓抑制、贫血和血小板下降，而伴皮肤或内脏出血。六、脱发、皮肤发红、瘙痒或皮疹。若需使用甲氨喋呤，应在医生指导下使用，定期监测肝、肾功能等。