在临床上应用胸腺肽治疗，可以提高人的免疫力，对于免疫缺陷的患者，治疗自身免疫性疾病方面都有比较广泛的应用。比如有一类人群，经常反复的感冒、发烧、患支气管炎、肺炎、肺结核这一类疾病，可以通过胸腺肽针的治疗起到预防作用。还有很常见的自身免疫性疾病的治疗，如有红斑狼疮、风湿、类风湿的这一类患者也可以进行胸腺肽治疗。另外恶性肿瘤的患者，经过放疗、化疗以后，导致机体免疫力下降，也可以用胸腺肽来辅助治疗。有先天性免疫缺陷引起继发性或者原发性的T细胞缺陷的患者，也可以用它作为替代性的治疗。