眼睛里长疖子建议使用抗生素类的药物进行治疗，必要时要到医院进行手术切除。眼睛里长疖子指的是睑板腺的炎症导致睑板腺发生炎症产生脓肿，多是由于细菌感染所导致的。建议患者及时到医院就诊，在医生指导下针对性地选择抗生素治疗眼部的疖肿，在病情得到控制的情况下可以使用热敷等方式促进脓肿的消退。如果疖子较大，严重影响患者的生活质量，建议通过手术切开排脓，防止脓液进入眼睛周围疏松组织内，并口服抗生素防治全身性的感染。