肠胃炎一般是由多种原因而引发的胃肠黏膜炎症，其主要的病因根据胃肠炎的类型而有所不同。感染性胃肠炎主要是由病原微生物感染，包括细菌，真菌，病毒，寄生虫等引发的感染性胃肠道表现。而非感染性胃肠炎主要见于应激反应，药物作用以及酗酒，食物过敏和自身免疫疾病等多种因素。另外各种因素导致的肠道菌群失调以及接触大量放射线而导致的放射性肠炎，免疫力低下以及婴幼儿喂养方式不恰当，都会引发肠胃炎的发生。