癫痫病目前最大的危害是脑损伤。这些脑损伤可能会导致大脑发育异常或者是认知功能受损，尤其是在发作期间的脑电图，频繁的出现癫痫波的异常，会对于记忆力和注意力的障碍非常的有影响。癫痫发作比较多的患者，尤其是大脑颞叶起源的患者，常常会伴有短时的记忆损害，并且随着时间的发展会越来越重。癫痫病如果频繁发作造成了一定的脑损伤，相对罹患多种精神疾病的风险也会增高，像抑郁、焦虑以及精神错乱。这种风险大小取决于病因、发作频率、发作的严重程度、患者的年龄、既往有没有情绪病史等有关。约20%的患者会罹患抑郁症的情况。癫痫患者的死亡风险大致比无癫痫人群的预期值要高两到三倍，增加的死亡率大部分都要归因于，潜在的癫痫原因情况。