肛门的位置如果发生了疼痛的话，那么还是需要先进行检查，再进行治疗。肛门位置的疼痛，比较常见的原因就是，有肛裂的情况，另外也不排除会有肛中脓肿的可能。如果痔疮发生了水肿，或者是有血栓形成的话，那么也是可能出现疼痛的情况。最好还是先要检查明确诊断，然后再进行对症的治疗。一般来说，痔疮或者是肛裂，早期是以药物的保守治疗为主，如果药物保守治疗效果不理想，也可以考虑通过手术等方法，进行对症的治疗。