灰指甲主要是由真菌感染导致的，所以在治疗方面，需要应用抗菌药杀死致病真菌，以免真菌繁殖导致病情恶化。一般情况下可以在医生的指导下口服特比萘芬、伊曲康唑等抗菌药物进行治疗。但是治疗灰指甲时，如果只是单靠口服药物的话，治疗效果可能不太理想。所以如果想要根治灰指甲，建议患者遵医嘱配合使用特比萘芬酊、阿莫罗芬甲搽剂、环吡酮胺酮甲涂剂等外用药物涂抹进行治疗。治疗灰指甲相对繁杂，疗程较长，患者要坚持信心，还要注意抽血检肝肾功能，以保证安全的用药和治疗。