肾结核患者阴茎出现疼痛，首选药物非甾体类抗炎镇痛药进行治疗，可以选择吲哚美辛栓塞肛，或者选择西乐葆，双氯芬酸钠等药物进行口服治疗，可以起到较好的镇痛效果。患者还需要去泌尿外科或者感染科进行就诊。因为肾结核属于泌尿系统结核范畴，也属于感染性疾病。肾结核如果没有有效控制，还会波及到其他泌尿生殖系统，会导致输尿管，膀胱，尿道，阴茎产生结核。所以要及时进行药物控制治疗，首选一线抗结核药，利福平，异烟肼，乙胺丁醇，吡嗪酰胺进行全程足量足疗程的治疗。