对于疱疹性咽峡炎治疗主要首先做好隔离，避免交叉感染，药物治疗个体差异大，用药没有绝对的最好，最快，最有效，通常可以采用对症治疗，如果腋下体温较高达到38.5℃以上的进行物理降温，也可以退热镇痛等进行降温，常用的退热药物有布洛芬，对乙酰氨基酚等。另外病因治疗目前没有特效药物，主要采用抗病毒的药物，可以用干扰素以及利巴韦林等抗病毒治疗以及辅助中医治疗，中医一般按照辨证论治给予清热解毒，祛湿或者清热除湿、益气养阴等治疗。疱疹性咽峡炎主要由肠道病毒感染引起的急性上呼吸道感染性疾病，主要病原体为柯萨奇病毒A型和肠道病毒71型。临床表现为发热，咽痛，咽峡部疱疹具有较强传染性。