服用阿苯达唑后，会有恶心，呕吐，发热，腹泻，头痛等身体不适症状，而且在停药后，这些症状可自行消失。在使用阿苯达唑治疗蛔虫疾病时，可见口吐蛔虫的情况，在使用阿苯达唑治疗棘球蚴病时，可引起变应性反应以及肝功能损害和脱发，还有骨髓抑制等严重的不良反应。孕妇如果服用阿苯达唑，也可以导致畸胎和胚胎毒性，所以对于妊娠期妇女以及哺乳期妇女，还有两岁以下的儿童是要禁用阿苯达唑的。少数病人服用阿苯达唑后，可以引起脑炎综合征，以及神经系统弥漫性病变受损的症状。所以对于阿苯达唑的应用，要在临床医生指导下用药，避免自行盲目滥用。