肛窦炎与痔疮为两种不同的疾病，其区别如下：首先是病因，肛窦为人体正常解剖结构，大便反复刺激造成肛窦部位损伤后，易造成肛窦炎。随时间的延长炎症控制不佳，可出现肛周脓肿甚至肛瘘。痔疮为常见的血管曲张疾病，其形成与腹腔压力增高有关，腹腔压力增高可导致痔区静脉回流不畅，可导致直肠下段与肛管周围静脉曲张，而痔疮本质是一团曲张的静脉。其次是症状，大多数肛窦炎可伴有肛门坠胀，疼痛感，而痔疮一般无明显的疼痛症状。部分出现血栓的痔疮，可称为血栓性痔，血栓性痔会引起肛门疼痛。