长期出现口臭应当就诊，以下两个科室。第一，消化内科。由于消化系统疾病所导致的消化不良，幽门螺杆菌感染等等都可能会引起患者长期有口臭的问题。所以如果明确存在上述消化系统疾病，及时对症治疗，再观察后期的口臭问题。第二，口腔科。由于口腔科本身的疾病，也可能会导致长期的口臭，比如慢性的牙龈炎，龋齿、牙髓炎等等口腔感染，经久不愈也会引起患者口臭，所以口腔科也是需要就诊的一个科室。