霉菌性尿道炎的治疗，包括：一，停用所有抗生素，使用抗霉菌药物，如制霉菌素，大扶康，氟康唑等。二是进行充分的冲洗，使用碳酸氢钠溶液，可以抑制霉菌的生产。三是治疗原发病，增强患者的抵抗力。霉菌感染尿道所引起的霉菌性尿道炎比较少见，一般多见于患者长期卧床，合并有肿瘤，糖尿病，免疫功能下降等，或者长期的有导尿，膀胱造瘘，肾造瘘病史，引起菌群失调，可以出现霉菌感染。一部分男性患者出现霉菌性尿道炎，可能与包皮过长，感染霉菌性的包皮龟头炎有关，只需要每天清洗龟头包皮，外涂抗霉菌药物，同时做包皮环切可以治疗。