三本学费高的主要原因：三本大学的概念是独立学院，独立内涵之一是财务独立，三本大学多为一本，二本大学举办的独立学院，三本大学转设为民办大学时，会与举办方脱离关系，相比公办高校，教师工资、教学设施等，全部由学校自身承担，学校没有国家财政拨款情况下，收入渠道靠学费收入等支撑。

一本和二本的学费每年在3000元至5000元，三本的学费每年在10000元到15000元。