有可能出现下列的不良反应：消化系统包括轻度的胃部不适，恶心，口腔异味等。神经系统包括头晕以及困倦，眩晕，颤抖，四肢麻木，痉挛和精神错乱等，过敏反应如皮疹，瘙痒等，其他有白细胞减少等。奥硝唑禁止用于对硝基咪唑类药物过敏的患者，脑和脊髓发生病变的患者，比如羊癫疯患者要禁用，气管硬化症，造血功能低下，慢性酒精中毒患者禁用，该损伤的患者用药每次的剂量与正常用量相同，但是用药间隔时间要加倍，以免药物蓄积。使用过程中，如果有异常神经的症状反应，应该立即停药并进一步观察治疗，妊娠早期也就是妊娠前三个月和哺乳期的妇女要慎用，儿童要慎用建议三岁以下的儿童不用。