肺结核通常需要完善相应的病原学检查来确诊，如行痰培养、痰结核菌涂片，如果上述痰检找到有结核杆菌的存在，可以确诊，有时还需要进一步的做菌种的鉴定。患者还可以行相应的病理活检来确诊，例如通过支气管镜的局部刷检活检，有时还可以经过经皮肺穿刺的病理活检，如果发现有干酪样坏死性的病灶形成，提示有结核杆菌的感染。