急性出血性结膜炎又被称作流行性出血性结膜炎，与病毒感染有关。因此，需要通过点抗病毒的滴眼液进行治疗，目前常用的有更西洛韦滴眼液、阿西洛韦滴眼液、重组人干扰素α2b滴眼液等。如果患者合并了细菌感染还需要加用抗生素滴眼液治疗，例如夫西地酸滴眼液、盐酸左氧氟沙星滴眼液等。如果病情进展炎症向角膜蔓延，则需要在抗病毒治疗的基础上，加用促进角膜修复的药物治疗，例如重组人表皮生长因子滴眼液、重组牛碱性成纤维细胞生长因子滴眼液、小牛血清去蛋白提取物眼用凝胶等。