引起干燥综合征的原因目前尚不清楚，可能与自身免疫、遗传，以及病毒感染、内分泌等因素都有关。在干燥综合征患者的体内可以检测出多种自身抗体、高球蛋白血症，有T细胞和B淋巴细胞功能异常。另外，在研究中也发现，人类白细胞抗原中的HLA-DR3与干燥综合征密切相关，这些提示患者发病可能与免疫和遗传因素有关。另外，有一些病毒感染，比如EB病毒、巨细胞病毒、HIV病毒可能与干燥综合征的发生也有关系。患者可能是在上述多种因素的综合作用下，在某些诱发因素的影响下，出现了病情发作。