治疗肛周脓肿，可以应用药物治疗，也可以应用肛周局部清洗，可以起到缓解症状，减轻疼痛的作用，可以口服中药，比如托里消毒散，起到益气补血、脱毒敛疮的作用。还可以口服二陈汤合百合固金汤，起到燥湿化痰消肿的作用。通过一些抗生素的口服，可以进行抗感染治疗，根据不同的致病菌株，选用敏感的抗生素，如果是结核性的脓肿，还应当配合抗结核药物治疗。平时要保持肛周清洁，可以应用温盐水或高锰酸钾溶液坐浴熏洗，还可以应用一些中药进行熏洗，起到减轻疼痛的作用。