肛瘘的患者采用药物治疗的话，只能够暂时的缓解症状，一般来说是使用抗生素类的药物来进行治疗，同时，如果患者不能够立即手术的话，要注意根据医生的指导使用高锰酸钾洗液温水坐浴的方式，来起到杀灭局部细菌的作用。患者要注意尽早的到正规的医院使用手术的方式来进行治疗，一般来说手术是将瘘管切开或者是切除，形成一个开放性的创面，以利于疾病的愈合。一般可以采用肛瘘切开术，肛瘘切除术，或者是挂线疗法来治疗。