沙眼衣原体具有独特的生物学特性，因此要求抗生素选择具有较好的细胞穿透性，所用的抗生素疗程，应延长或使用半衰期长的抗生素。可以选用的治疗方案为：阿奇霉素1克，单剂口服，或多西环素100mg，每日2次，7-10天，或米诺环素100mg，每日2次，共10天，或四环素500mg，每日4次，共7-10天，或罗红霉素150mg，每日2次，7-10天。需要注意的是，四环素类的药物一般疗效都比较好，但是大多会选用多西环素，因为多西环素每日服药的次数减少，而且耐受性好，半衰期长。