肛瘘如果出现了急性的感染，可以口服抗生素药物进行对症的治疗。可以口服头孢类的抗生素，也可以口服替硝唑、甲硝唑或者是奥硝唑等药物进行对症的治疗。肛瘘一般是由于肛周脓肿成了溃破，或者是肛周脓肿在形成脓液以后，进行了人为的切开放脓就会形成肛瘘的状态。肛瘘和肛周脓肿是属于同一个疾病的两个过程。在诊断明确以后，主要的治疗方法是需要通过手术进行治疗。单纯的依靠药物进行治疗，主要是以改善症状为主，肛瘘会反复地发作。肛瘘在诊断明确以后还是要及时地进行治疗。在完成手术治疗以后按时进行换药，保持手术创面引流的通畅，保持肉芽组织的新鲜。