慢性结肠炎的药物治疗，包括以下两个方面：（1）病因治疗 ：①抗感染药：根据细菌培养及细菌药敏试验，选用针对致病菌的抗感染药物，如氟哌酸胶囊、环丙沙星、甲硝唑、柳氮磺胺吡啶水杨酸制剂（艾迪莎、美沙拉嗪）等，或抗生素保留灌肠，如复方诺氟沙星灌肠液。②皮质类固醇：常用药为强的松或地塞米松，但目前并不认为长期激素维持可防止复发。（2）对症治疗 ：①胃肠解痉药，如阿托品、普鲁本辛、硝苯地平等；②止泻药，如复方樟脑酊、思密达、洛哌丁胺等；③肠道菌群调节药，如双歧杆菌活菌制剂、双歧三联活菌制剂、乳酸杆菌等；④增加胃肠蠕动药，如吗丁啉、西沙必利等；⑤缓解便秘药，如口服果导片、外用石蜡油、开塞露等。