在大便的时候，肛门如果疼，首先还是需要先到肛肠科做局部的检查进行判断。另外也要根据疼痛的性质做初步的判断，如果是刀割样或者是撕裂样的疼痛，首先就是考虑有肛裂的存在。如果是肛门下坠疼痛，那么不排除是由于痔疮发生了水肿或者是有血栓形成的情况。如果是鼓胀样的疼痛，那么就要排除是不是有肛周脓肿，直肠黏膜下脓肿这一类感染化脓性的疾病。如果是痔疮或者是肛裂，可以先进行药物的对症治疗。但如果是脓肿或者是黏膜下的脓肿，就要早做手术的治疗。