不同的卵巢囊肿预防复发有不同的方式。如果是由卵巢正常的组织病变所导致的卵巢囊肿，只要正常卵巢组织存在，其就会有一定的复发概率，没有很好的预防手段。如果是有外源性的组织侵犯卵巢形成的囊肿，例如子宫内膜异位囊肿，可以通过药物治疗萎缩子宫内膜组织而达到预防复发的作用。如果是卵巢的生理性囊肿，它会随月经周期出现生理性的增大以及萎缩，不用进行特殊的处理，不会导致女性出现严重的症状。如果是卵巢的恶性肿瘤，一般需要通过手术切除卵巢以及输卵管、子宫等生殖器官，所以手术以后一般不会出现卵巢部位的复发，但有可能出现其他部位因肿瘤细胞存在而引起的复发。