肛门疼痛吃药要根据病因来选择。如果是因为血栓性的外痔所导致的疼痛，在急性发作期时，可以口服非甾体抗炎药物进行止痛治疗，局部可配合用清热解毒消炎止痛的中药洗剂作用，促进肛周的血液循环缓解疼痛。如果是因为肛周脓肿所引起的肛门疼痛，需要做手术切开清除里面的脓液，再服用阿莫西林、罗红霉素等抗生素止痛抗炎治疗。服药期间，饮食忌吃甘厚肥腻，辛辣、刺激的食物，多吃新鲜的蔬菜水果，保持大便通畅，避免久坐加重疼痛。