部分男性滴虫病患者可以出现无症状，有症状者主要表现为尿道分泌物、尿道不适和尿频，与其他原因引起的尿道炎难以区别，也可表现为龟头炎，极少数可导致前列腺炎、附睾炎及不育。滴虫常寄生于人的泌尿生殖道，主要侵犯泌尿生殖道鳞状上皮，故常见的临床表现为阴道分泌物增多或异常，或尿道不适。部分患者出现慢性感染，通常症状较轻，可有瘙痒和性交痛。