新生儿咳嗽有痰的时候，考虑有呼吸道的炎症，一般咳嗽有痰的原因都是因为病毒性感染。因为新生儿的抵抗力是比较弱的，如果发生病毒感染的情况，很容易并发细菌性感染，可以给孩子使用抗病毒的药物和抗生素一起治疗。抗病毒的药物可以选择蒲地蓝消炎口服液或者四季抗病毒合剂；抗生素可以选择小儿头孢克肟颗粒，但是要注意观察孩子的情况，不要服用之后出现过敏的情况。还需要给孩子结合雾化吸入治疗，可以到医院给孩子物化吸入布地奈德和特布他林这两种药物进行治疗，一天需要雾化吸入两次。