钩虫性十二指肠炎综合征，主要是因为感染了钩虫导致的十二指肠炎，因此在治疗时首先是根据病因选择用药治疗，给患者口服驱虫药物，比如口服甲苯，米唑丙硫米唑等驱虫药物。如果出现了上腹部不适，并且有腹痛、腹胀、恶心、呕吐等症状时，还需要给患者口服保护胃肠粘膜的药物，以及对症处理的药物，必要时也可以使用中药汤剂治疗。但是该种疾病服用抑制胃酸分泌的药物没有效果，具体药物的用法用量，要在临床医生的指导下应用。