主要有溃疡性结肠炎、克罗恩病。溃疡性结肠炎主要药物为氨基水杨酸制剂，疗效不佳者改用糖皮质激素，免疫抑制剂可试用于对激素无效或依赖者。 克罗恩病活动期，柳氮磺吡啶仅适于病变局限在结肠的轻度患者，美沙拉嗪适于轻度回结肠型及轻度结肠型患者；糖皮质激素适于中、重度患者及对5-氨基水杨酸制剂无效的中度患者；激素无效或依赖者考虑加用免疫抑制剂，不良反应有骨髓抑制，应用时应严密监测；某些抗菌药有一定疗效，可短期用；疗效不佳可考虑生物制剂如英夫利昔单抗；缓解期以上述取得缓解的药物维持治疗。