衣原体是一种专性胞内寄生的原核生物, 感染人体后可引起一系列疾病。衣原体是一类严格真核细胞内寄生, 可以在多种真核生物宿主 (包括人、动物、原虫等) 中繁殖的原核细胞型微生物。衣原体感染宿主细胞后, 会通过调节宿主细胞的一些代谢机制, 为自身的生存提供更有利的条件, 如获得更多的能量或代谢物, 同时使机体正常细胞发生相应的改变, 导致一系列疾病的发生。在众多的衣原体中，与人类疾病有关的主要有沙眼衣原体、鹦鹉热衣原体和肺炎衣原体。能够引起人体多种疾病，以慢性炎症性疾病为主，可形成持续性感染。沙眼衣原体可引起眼部感染导致致盲 (沙眼) , 也能引起输卵管性不孕 (输卵管阻塞) ; 肺炎衣原体可引起咽炎、肺炎等呼吸道感染疾病; 鹦鹉热衣原体可由动物传染给人, 导致严重的人畜共患病。