吡哌酸的副作用主要集中在神经系统、胃肠道系统、骨骼系统以及过敏反应，吡哌酸临床上主要用于治疗，敏感菌引起的肠道感染和尿路感染。长期服用吡哌酸可能会影响儿童的软骨发育，18岁以下的儿童、妊娠以及哺乳期的妇女禁止服用吡哌酸。服用吡哌酸可能会造成恶心、上腹不适、食欲减退等胃肠道副作用，和食物一起服用可以减少对胃肠道的刺激。吡哌酸还可能发生头晕、头痛等神经系统反应，吡哌酸的最严重的副作用是过敏反应，甚至可能会发生过敏性的休克，或者中毒性的表皮坏死松解症。在服用吡哌酸期间，一旦出现了皮疹、瘙痒、寒战、呼吸困难以及低血压等症状，应该立即停药，并及时到当地的正规医疗机构就诊。