肾盂肾炎主要与感染、病毒、先天性发育不良、尿路梗阻等因素有关。肾盂肾炎分为急性肾盂肾炎和慢性肾盂肾炎，急性肾盂肾炎发病较急，绝大多数是由于下尿路感染逆行向上而引起的，最常见的是大肠杆菌。而慢性肾盂肾炎的病因比较复杂，比较常见的原因是由于急性肾盂肾炎没有得到彻底的治愈，病情迁延不愈而导致的。尿路感染如膀胱炎、尿道炎等，反复发作没有治愈，细菌逆行进入到肾盂，也会引起慢性肾盂肾炎。另外，慢性尿路梗阻因素，比如：输尿管结石、前列腺增生肥大、先天性肾盂输尿管狭窄等，也可能会导致出现慢性肾盂肾炎。