新生儿湿疹的发病机制尚不完全清楚，一般认为可能是遗传因素与环境因素相互作用，并通过免疫途径介导产生的结果。可能与下面因素相关：第一、遗传学说，很多湿疹患儿的父母有湿疹的病史；第二、免疫学说，患儿常存在免疫学的异常，包括IgE水平升高，嗜酸粒细胞增多，朗格汉斯细胞数量异常等；第三、环境因素，外界环境中的变应原，可诱发湿疹；第四、皮肤屏障功能异常，患儿的皮肤干燥，脱屑易导致湿疹的发生。