直肠癌和其他恶性肿瘤一样，至今病因并没有完全明了，但是可能和以下的因素有一定的相关性。我们说肿瘤的发生其实是人体本身的内在因素和周围大环境的外在因素共同作用，长时间所导致的一个疾病的发生。内因当中直肠癌的话目前考虑遗传与大肠癌相关性，估计约1/5的直肠癌患者当中遗传因素起着重要的作用。其次是考虑饮食因素。目前，一般认为，高动物蛋白、高脂肪和低纤维素的饮食是直肠癌高发的一个因素。另外，目前患者像生活习惯的改变，少运动而且久坐导致患者肥胖，这些因素也是导致发生直肠癌的一个高发因素。其他的一些因素，像大肠的非癌性疾患，常见的像直肠的息肉、腺瘤等等，进一步演变有可能会发生直肠癌恶变的情况。还有一些环境的因素，像一些缺少一些微量元素的地区，像缺钼的地区，直肠癌发生率相对高一些，还有些接触石棉的人发生直肠癌的几率高一些。所以说直肠癌的发生与很多因素有相关性，但是具体病因尚不明了。