尿道疼如何选择药物治疗是和患者的病因有关系的，如果是因为尿路感染引起的尿道疼痛，有尿频尿急等症状，可以在医生的指导下使用抗生素治疗。在使用药物之前最好化验一下尿常规，尿培养和药物敏感试验，根据药敏选择敏感的抗生素治疗。如果是因为尿路结石而引起的尿痛，需要通过多喝水多排尿，有利于改善患者的症状，也可以在医生的指导下使用排石的药物。