在临床上，痔疮与肛瘘的区别点有很多，比如说：第一，发病原因，痔疮的发病原因并不是很清楚，只是考虑多种因素引起肛垫发生移位。肛周皮下血管发生于区，而肛瘘的发病原因则比较明确，大多数情况下考虑是肛周脓肿发生自行破溃或者进行肛周脓肿切开引流术后而形成瘘管。第二，临床症状，痔疮的临床症状主要是便血，肛门内包块脱出于肛门口外，肛门口的潮湿，瘙痒，疼痛等等。而肛瘘的主要临床症状发生在外口外口，间断性的出现肿胀，疼痛，破溃，流脓。第三，治疗，痔疮首选非手术治疗，不缓解再考虑手术治疗，而肛瘘则首选手术治疗，有时候也可以选择非手术治疗。