阿卡波糖这种药物是比较安全的，食物中的淀粉糊精和双糖的吸收需要小肠黏膜刷状缘的葡萄糖苷酶，阿卡波糖可以抑制这一类酶，从而减缓碳水化合物的吸收，降低餐后高血糖。阿卡波糖作为治疗2型糖尿病的一线药物，尤其适用于空腹血糖正常而餐后血糖明显升高的病人，有脂肪肝的患者也可以使用阿卡波糖。最严重的副作用是胃肠道功能紊乱，因糖类在小肠内分解和吸收障碍，而在结肠内由于细菌作用末吸收的糖类而导致胃肠胀气如腹胀，腹泻和腹痛，另有报道可引起肝细胞的肝损伤。伴有黄疸和转氨酶升高，停药后可以缓解。过敏反应皮肤反应比较少见。