小便痛的常见原因是由于泌尿系统的感染，比如最常见的就是普通的尿路感染，包括革兰氏阳性菌或者是革兰氏阴性菌，最常见的就是大肠杆菌或者是金黄色葡萄球菌，表现为尿痛、尿频、尿急甚至尿失禁。第二就是由于特殊类型的炎症，比如尿道综合征也会出现类似症状，但是尿常规检查正常，病人也不会出现尿痛，有的会出现轻微的刺痛或隐痛。第三是特殊性的疾病，比如间质性的膀胱炎，也有可能会出现耻骨上膀胱区的疼痛，特别是在尿量增加，憋尿的时候疼痛会加重。