两侧太阳穴痛，注意神经性头痛，体温升高以及熬夜、紧张情绪等因素都有可能导致，一般情况下如果是短期内出现疼痛，要注意感冒、体温升高等原因引起。如果反复出现两侧太阳穴疼痛，要注意神经性头痛引起，这种情况下应该及时的检查确定导致的原因，要高度注意神经系统疾病。所以，一开始应该考虑一般因素引起，如果怀疑疾病因素的时候，可以进行脑部的影像学检查，来确定一下是否存在器质性疾病引起的两侧太阳穴痛。