身体疼痛很多时候是肌肉酸痛，身体在感受到了外来病原体的入侵就会启动一系列的免疫反应，这个免疫反应会产生大量的抗体，消耗很多的能量产生乳酸等，伴随而来的就是体温升高，血流加快，肌肉酸痛。免疫细胞会进攻病原体或者产生抗体消灭病原体，被消灭的病原体残渣导致了血液成分的变化，也会让人产生疼痛的感觉。当病毒和病菌进入呼吸道过后找到某处适合繁殖生长的地方，就在那里大量繁殖，如果病毒或者病菌的入侵比较深入不仅仅是在呼吸道表层而是进入深层组织，这个时候病毒或者病菌很容易伴随着血液流向身体的各处，到达身体的其它部位进行多次感染，会挤压正常细胞的生存空间与正常细胞抢夺营养，细胞的非正常死亡就会让身体产生痛觉的信号。还有一种情况就是病原体会产生外毒素，这些毒素进入血液流向全身，对身体进行攻击，可以杀死细胞和组织，这样的情况就是毒血症。根据情况不同又有毒血症、菌血症、败血症、脓毒血症等区分，从而导致全身疼痛。