肾穿刺有后遗症，具体的后遗症如下：1、镜下血尿。只要做肾穿刺活检，就会发生镜下血尿，但术后5天内会自动消失。2、肾周血肿。肾周血肿发生率是60%-90%之间，如果没有明显的临床症状，可能会在两周内吸收。如果出现明显的临床症状，就要进行手术治疗。3、腰痛。腰痛发生率是17%-60%之间，肾穿刺活检后一周腰痛的就会明显消失。4、损伤其他脏器。如果在做肾穿刺活检时，穿刺点不到或者穿刺针过深，会损伤其他脏器。建议选择当地综合性更高的医院做肾穿刺，安全性更高一些。